出資人不同：個人獨資企業由單個自然人進行投資，出資人只有一個；而合伙企業則必須由兩個以上的自然人、法人或其他組織共同出資設立，出資人至少為兩人。 企業財產與責任承擔不同：個人獨資企業的財產為投資人個人所有，其投資人原則上以個人財產對企業債務承擔無限責任；合伙企業的財產則是由各合伙人出資所形成的，當合伙企業財產不足以清償合伙企業債務時，各合伙人需要以其投入合伙企業的財產以外的其他財產對合伙企業債務承擔無限連帶責任。 企業事務的管理方式不同：個人獨資企業的投資人對企業事務管理具有最終的決定權，可以獨自出資、獨自經營并自行作出決策；而合伙企業則可以在各合伙人訂立合伙協議的前提下，共同出資、共同經營，企業事務管理可以由全體合伙人共同執行，也可以由合伙人約定或全體合伙人決定，委托一名或數名合伙人執行，但重大事項仍然需要全體合伙人共同決定。 法律依據與法律地位不同：個人獨資企業依據《個人獨資企業法》設立，并受其調整，其法律地位為非法人；合伙企業依據《合伙企業法》設立，并受其調整，其法律地位同樣為非法人。公司制企業則依據《公司法》設立，受《公司法》調整，其法律地位為企業法人。