季度申報增值稅的時候，需要填進去嗎？因為目前他是直接提取開具發票的數據來申報的

對的對的需要填寫。

據《財政部?稅務總局關于租入固定資產進項稅額抵扣等增值稅政策的通知》(財稅〔2017〕90號)的規定:自2016年5月1日起,社會團體收取的會費,免征增值稅。免征還需要申報嗎？我有點搞不懂？

做申報的，你申報不一定交稅呀。