已抵扣進項稅額轉出的稅務處理方式是將其作為應交稅金處理，記入負債或者其他應付款科目，同時在資產負債表中披露。具體會計分錄如下：

借：應交稅金/其他應付款
貸：進項稅額

需要注意的是，抵扣進項稅額轉出是因為發生了退貨、折讓等原因導致銷售額減少，而進項稅額已經抵扣，所以需要將已抵扣的進項稅額轉出并作為應交稅金處理。