工程審計程序包括以下步驟：
1. 確定審計目標和范圍：根據審計需求和客戶要求，確定審計目標和范圍，包括審計的時間期限、審計范圍和審計目標等。
2. 審計計劃的制定：根據審計目標和范圍，制定審計計劃，包括審計人員的分配、審計時間表、審計程序等。
3. 審計準備工作：進行審計前的準備工作，包括收集相關資料、了解審計對象的背景和歷史、了解審計對象的內部控制系統等。
4. 審計程序的執行：根據審計計劃和程序，對審計對象進行審計程序的執行，包括進行實地調查、進行文件分析、進行內部控制評價、進行風險評估等。
5. 審計結果的分析和總結：對審計程序的執行結果進行分析和總結，確定審計發現和問題，并提出建議和意見。
6. 編寫審計報告：根據審計結果，編寫審計報告，包括對審計對象的評價、審計發現和問題、建議和意見等。
7. 審計報告的審批和發布：對審計報告進行審批和發布，包括對審計報告的內容、形式和語言進行審查和修改，并確定審計報告的發布方式和時間。