當申報個人獨資企業的經營所得稅時，應當扣除工資和獎金。申報時，對企業支付的工資和獎金應當從經營所得稅中扣除，以確定納稅人的實際應納稅所得額。根據《企業所得稅法》，企業應當向其雇員支付的工資和獎金，可以從納稅人應納稅所得額中扣除，以減少納稅人應納稅所得額，進而減少納稅人繳納稅款的總額。此外，對于繳納社會保險金的應減免部分，可以從所得稅收入中扣除，以減少納稅人的稅收負擔。總之，在申報個人獨資企業的經營所得稅時，應當根據相關法律法規，科學準確地計算應扣除的工資和獎金，以達到納稅義務的履行。