外貿企業出口退稅以進貨專用發票為依據，要求進項不得抵扣。取得專用發票認證后，直接在增值稅申報表附表二的第26、27、28欄填列。對有一些地區可以對該出口退稅所用的發票先進行抵扣，然后再做進項轉出，這種模式需要征得主管稅局同意后方可操作。 根據國稅公告201224號的要求，已抵扣的進貨發票不得申請退稅，因此對于先抵扣再轉出的這種操作(上海地區多采用該模式)需要先征得主管稅局的認可，否則會有不得退稅的風險。(若采用退稅勾選的則直接按待抵扣進行申報)。